MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 53222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	ATG	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792284
2	NC_014721	AGG	2	6	107	112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312792284
3	NC_014721	A	6	6	118	123	100 %	0 %	0 %	0 %	312792284
4	NC_014721	AT	3	6	146	151	50 %	50 %	0 %	0 %	312792284
5	NC_014721	GT	3	6	184	189	0 %	50 %	50 %	0 %	312792284
6	NC_014721	AAC	2	6	390	395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792284
7	NC_014721	TGT	2	6	429	434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792284
8	NC_014721	AAC	3	9	439	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792284
9	NC_014721	ACC	2	6	486	491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792284
10	NC_014721	CGG	2	6	525	530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312792284
11	NC_014721	ATGC	2	8	556	563	25 %	25 %	25 %	25 %	312792284
12	NC_014721	CAT	2	6	571	576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792284
13	NC_014721	ATGT	2	8	607	614	25 %	50 %	25 %	0 %	312792284
14	NC_014721	GAC	2	6	715	720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312792284
15	NC_014721	GGAAA	2	10	736	745	60 %	0 %	40 %	0 %	312792284
16	NC_014721	AAG	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792284
17	NC_014721	CA	3	6	766	771	50 %	0 %	0 %	50 %	312792284
18	NC_014721	AAG	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792284
19	NC_014721	ATA	2	6	802	807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792284
20	NC_014721	TCA	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792284
21	NC_014721	CCA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792284
22	NC_014721	AGA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792284
23	NC_014721	ACC	2	6	897	902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792284
24	NC_014721	A	6	6	934	939	100 %	0 %	0 %	0 %	312792284
25	NC_014721	AAAC	2	8	1001	1008	75 %	0 %	0 %	25 %	312792284
26	NC_014721	AG	3	6	1012	1017	50 %	0 %	50 %	0 %	312792284
27	NC_014721	CAA	2	6	1032	1037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792284
28	NC_014721	ACACAA	2	12	1121	1132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792284
29	NC_014721	A	7	7	1131	1137	100 %	0 %	0 %	0 %	312792284
30	NC_014721	AAG	2	6	1212	1217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792284
31	NC_014721	AGGCG	2	10	1296	1305	20 %	0 %	60 %	20 %	312792284
32	NC_014721	CA	3	6	1321	1326	50 %	0 %	0 %	50 %	312792284
33	NC_014721	A	6	6	1346	1351	100 %	0 %	0 %	0 %	312792284
34	NC_014721	A	7	7	1405	1411	100 %	0 %	0 %	0 %	312792284
35	NC_014721	AAT	2	6	1427	1432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792284
36	NC_014721	TGT	2	6	1659	1664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792285
37	NC_014721	CTG	2	6	1706	1711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312792285
38	NC_014721	CAA	2	6	1718	1723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792285
39	NC_014721	GT	3	6	1743	1748	0 %	50 %	50 %	0 %	312792285
40	NC_014721	ACA	2	6	1780	1785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792285
41	NC_014721	AGATGC	2	12	1796	1807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312792285
42	NC_014721	AAGCT	2	10	1856	1865	40 %	20 %	20 %	20 %	312792285
43	NC_014721	A	6	6	1882	1887	100 %	0 %	0 %	0 %	312792285
44	NC_014721	TGAGGT	2	12	1899	1910	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312792285
45	NC_014721	AGA	2	6	1917	1922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792285
46	NC_014721	AAG	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792285
47	NC_014721	AGA	2	6	1946	1951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792285
48	NC_014721	TTG	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792285
49	NC_014721	TTG	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792285
50	NC_014721	AGA	3	9	2127	2135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792285
51	NC_014721	TTG	2	6	2150	2155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792285
52	NC_014721	T	6	6	2299	2304	0 %	100 %	0 %	0 %	312792285
53	NC_014721	CAA	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792285
54	NC_014721	T	6	6	2368	2373	0 %	100 %	0 %	0 %	312792285
55	NC_014721	AATTTC	2	12	2412	2423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312792285
56	NC_014721	GA	3	6	2449	2454	50 %	0 %	50 %	0 %	312792285
57	NC_014721	GAT	2	6	2517	2522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792285
58	NC_014721	TGGA	2	8	2645	2652	25 %	25 %	50 %	0 %	312792285
59	NC_014721	GA	3	6	2651	2656	50 %	0 %	50 %	0 %	312792285
60	NC_014721	GAC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312792285
61	NC_014721	ATCT	2	8	2722	2729	25 %	50 %	0 %	25 %	312792285
62	NC_014721	TTC	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792285
63	NC_014721	T	6	6	2834	2839	0 %	100 %	0 %	0 %	312792286
64	NC_014721	ATAAA	2	10	2850	2859	80 %	20 %	0 %	0 %	312792286
65	NC_014721	CTTCT	2	10	2892	2901	0 %	60 %	0 %	40 %	312792286
66	NC_014721	CTA	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792286
67	NC_014721	TAGA	2	8	3039	3046	50 %	25 %	25 %	0 %	312792286
68	NC_014721	AGAGA	2	10	3052	3061	60 %	0 %	40 %	0 %	312792286
69	NC_014721	AAG	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792286
70	NC_014721	GTTT	2	8	3118	3125	0 %	75 %	25 %	0 %	312792286
71	NC_014721	T	8	8	3123	3130	0 %	100 %	0 %	0 %	312792286
72	NC_014721	CTT	2	6	3251	3256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792286
73	NC_014721	ATA	2	6	3296	3301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792286
74	NC_014721	AGG	2	6	3357	3362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312792286
75	NC_014721	AGA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792286
76	NC_014721	TTTAG	2	10	3398	3407	20 %	60 %	20 %	0 %	312792286
77	NC_014721	CTTG	2	8	3424	3431	0 %	50 %	25 %	25 %	312792286
78	NC_014721	AT	3	6	3439	3444	50 %	50 %	0 %	0 %	312792286
79	NC_014721	A	6	6	3490	3495	100 %	0 %	0 %	0 %	312792286
80	NC_014721	ACA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792286
81	NC_014721	GAC	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312792286
82	NC_014721	CTTCT	2	10	3642	3651	0 %	60 %	0 %	40 %	312792286
83	NC_014721	A	6	6	3712	3717	100 %	0 %	0 %	0 %	312792286
84	NC_014721	AGA	2	6	3763	3768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792286
85	NC_014721	TA	3	6	3838	3843	50 %	50 %	0 %	0 %	312792286
86	NC_014721	A	6	6	3843	3848	100 %	0 %	0 %	0 %	312792286
87	NC_014721	CTT	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792287
88	NC_014721	GTT	3	9	4003	4011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792287
89	NC_014721	ATG	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792287
90	NC_014721	A	6	6	4026	4031	100 %	0 %	0 %	0 %	312792287
91	NC_014721	TAA	2	6	4037	4042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792287
92	NC_014721	ATA	2	6	4072	4077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792287
93	NC_014721	GATT	2	8	4153	4160	25 %	50 %	25 %	0 %	312792287
94	NC_014721	GGATA	2	10	4196	4205	40 %	20 %	40 %	0 %	312792288
95	NC_014721	TA	3	6	4287	4292	50 %	50 %	0 %	0 %	312792288
96	NC_014721	CAC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792288
97	NC_014721	A	6	6	4468	4473	100 %	0 %	0 %	0 %	312792288
98	NC_014721	TTC	2	6	4498	4503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792288
99	NC_014721	GA	3	6	4524	4529	50 %	0 %	50 %	0 %	312792288
100	NC_014721	GGT	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312792288
101	NC_014721	TGT	2	6	4571	4576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312792288
102	NC_014721	TGA	2	6	4823	4828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792288
103	NC_014721	ATG	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792288
104	NC_014721	ACA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792288
105	NC_014721	CAA	2	6	5032	5037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792288
106	NC_014721	GGT	2	6	5043	5048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312792288
107	NC_014721	CTG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312792288
108	NC_014721	A	7	7	5102	5108	100 %	0 %	0 %	0 %	312792288
109	NC_014721	CTT	2	6	5136	5141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792288
110	NC_014721	TGTC	2	8	5176	5183	0 %	50 %	25 %	25 %	312792288
111	NC_014721	GC	3	6	5241	5246	0 %	0 %	50 %	50 %	312792288
112	NC_014721	T	6	6	5285	5290	0 %	100 %	0 %	0 %	312792288
113	NC_014721	AGA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
114	NC_014721	A	6	6	5312	5317	100 %	0 %	0 %	0 %	312792288
115	NC_014721	GGC	2	6	5339	5344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312792288
116	NC_014721	GC	3	6	5349	5354	0 %	0 %	50 %	50 %	312792288
117	NC_014721	A	6	6	5363	5368	100 %	0 %	0 %	0 %	312792288
118	NC_014721	AG	3	6	5373	5378	50 %	0 %	50 %	0 %	312792288
119	NC_014721	CTG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312792288
120	NC_014721	AAG	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
121	NC_014721	CTT	3	9	5733	5741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792288
122	NC_014721	CTTT	2	8	5743	5750	0 %	75 %	0 %	25 %	312792288
123	NC_014721	CCA	2	6	5802	5807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792288
124	NC_014721	ACC	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312792288
125	NC_014721	AAG	2	6	5966	5971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
126	NC_014721	TTC	2	6	5974	5979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312792288
127	NC_014721	AGA	2	6	6011	6016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
128	NC_014721	AAG	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
129	NC_014721	AG	3	6	6057	6062	50 %	0 %	50 %	0 %	312792288
130	NC_014721	AGA	2	6	6070	6075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792288
131	NC_014721	AT	3	6	6100	6105	50 %	50 %	0 %	0 %	312792288
132	NC_014721	AAGA	2	8	6136	6143	75 %	0 %	25 %	0 %	312792289
133	NC_014721	GAA	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792289
134	NC_014721	ATT	2	6	6242	6247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312792289
135	NC_014721	GAA	2	6	6262	6267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792289
136	NC_014721	AGAT	2	8	6292	6299	50 %	25 %	25 %	0 %	312792289
137	NC_014721	TA	3	6	6408	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	312792290
138	NC_014721	AGA	2	6	6483	6488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
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401	NC_014721	ATG	2	6	20110	20115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792296
402	NC_014721	GCCA	2	8	20143	20150	25 %	0 %	25 %	50 %	312792296
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